http://dpt-info.u-strasbg.fr/~cronse/TSATI/

Licence de Sciences du Vivant, 2ère année

Module
Traitement du Signal, Acquisition et Traitement d'Images

13 h. cours, 13 h. TD, 8 h. TP

Christian RONSE, LSIIT UMR 7005 CNRS-ULP, Département d'Informatique de l'ULP
et
Vincent AGNUS, IRCAD (Institut de Recherche contre les Cancers de l'Appareil Digestif)

Programme :

1. Types de signaux (spatial/temporel, uni/multi-dimensionnel, uni/multi-valué, analogique/discret).
2. Signaux uni-dimensionnels: séquences génomiques, EEG, ECG, etc.
3. Modalités d'acquisition des images (photo, caméra CCD, microscopie électronique, radiographie X, tomographie X, IRM, echographie, scintigraphie, TEMP, TEP, etc.).
4. Représentation informatique de l'image. Résolution spatiale et quantification des niveaux de gris. Couleur et pseudocouleur.
5. Opérations sur les niveaux de gris, rehaussement du contraste.
6. Pixels, adjacences, chemins, distances et connexité.
7. Opérations spatiales: lissage et rehaussement, filtrage.
8. Détection de contours.
9. Utilisation de logiciels gratuits (XV, GIMP).

Ouvrages de référence :

Murray J.D., vanRyper W., Encyclopedia of Graphics File Formats, 2nd ed., O'Reily & Associates (1996).
Russ J.C., The Image Processing Handbook, 3rd ed., CRC Press (1999).

(Ces ouvrages sont normalement disponibles au SCD.)

Sujets d'examen :

• Juin 2002 (IUP2) : fichier Postcript ou PDF.
• Janvier 2003 (IUP1) : fichier Postcript ou PDF.
• Janvier 2004 (IUP1) : fichier Postcript ou PDF.
• Janvier 2005 (IUP1) : fichier Postcript ou PDF.
• Janvier 2006 (L2) : fichier Postcript ou PDF.
• Janvier 2007 (L2) : fichier Postcript ou PDF.
• Janvier 2008 (L2) : fichier Postcript ou PDF.
• Janvier 2009 (L2) : fichier Postcript ou PDF.
• Janvier 2010 (L2) : fichier Postcript ou PDF.
• Janvier 2011 (L2) : fichier Postcript ou PDF.

Sujets de TDs/TPs :

TD 1 : Nombres binaires, vision humaine et fonctions de contraste.
TD 2 : Histogrammes.
TD 3 : Connexités et distances.
TD 4 : Filtrage spatial (grille pour le calcul des filtres).
TP 1 : Contrastes
TP 2 : Couleurs

Anciens sujets de TDs/TPs (plus détaillés) :

TD 1  /  TD 2  /  TD 3  /  TD 4  /  TD 5  /  TP 1  /  TP 2  /  TP 3

Documentation disponible sur le web :

Détection de répétitions de motifs dans des séquences :   http://dpt-info.u-strasbg.fr/~cronse/TSATI/GEN/autocor.html

Supports de cours de Traitement d'Images :   http://dpt-info.u-strasbg.fr/~cronse/TIDOC/index.html

Y prendre les documents indiqués de "niveau élémentaire", c.à.d. non marqués d'un carré  ;
certains documents de niveau "standard", c.à.d. marqués d'un carré , pourront être utilisés, mais pas en entier :

Visualisation
   Principes élémentaires de photographie.
   Résolution spatiale et quantification des intensités.
   Couleurs et gamma
   Quelques transformations des niveaux de gris d'une image.
   Rehaussement des niveaux de gris dans une image.
   L'histogramme d'une image discrète à niveaux de gris, et son égalisation.
Topologie Discrète
   Le plan discret : pixels et adjacences.
   Chemins, distances, connexité.
Géométrie Discrète
   Comparaison des distances 4, 8 et euclidienne.
Extraction de traits
   Seuillage des images à niveaux de gris.
Filtrage spatial
   Filtres linéaires : convolution et corrélation.
   Lissage, accentuation et rehaussement linéaires.
   Filtres d'accentuation des arêtes.
   Normalisation de filtres linéaires.
   Le filtre médian.
   Le filtre de Kramer et Bruckner.
   Gestion des fenêtres d'un filtre au bord de la grille.
Morphologie Mathématique
   Opérations morphologiques de base : dilatation, érosion, ouverture et fermeture binaires

Sites web officiels de
  XV : http://www.trilon.com/xv/
  GIMP : http://www.gimp.org/

(On y trouvera entre autres des manuels et des ressources.)